加拿大国立医疗保健科学研究院（NIH）的下属国家有机体突变组科学研究所（NHGRI）的科学研究执法人员从未采购出有机体等位突变的第一个端对端DNA核酸。近日发表在《Nature》杂志上的相关科学研究报告感叹明，科学研究执法人员无论如何降解一个可靠的人等位突变逐个DNA核酸，这将加速人突变组零碎核酸的初版。
NHGRI主任、临床博士Eric Green感叹：“这项科学研究开启了分子生物学科学研究的新纪元。必需降解毫无疑问零碎的等位突变和突变组核酸的能力也是一项应用专精，将有助于我们全面认识突变组动态，并为临床护理之中突变组文档的用于透过文档。”
2003年，科学研究执法人员首次完成了有机体突变组的测序工作。随着科学研究的不断深入和应用的不断改进，有机体突变组踏入有史以来最可靠和最零碎的脊椎动物突变组核酸。然而，目前为止即使如此存在数百个未知的缺口或纠正的DNA核酸，其之中包含着难以识别的单调DNA视频，可能伸展了与有机体健康和病因有关的突变和其他动态元件。
有机体突变组之中大概有60亿个DNA，而DNA测序仪很难一次全部载入。因此，科学研究执法人员将突变组长条相当大的视频，然后比对每个视频，一次产生数百个DNA的核酸，并将这些较短的DNA核酸拼凑。
在这项科学研究之中，科学研究执法人员首先举例来说了X等位突变核酸同步进行测序，因为它与无数的X等位突变病因相关，包括前列腺癌，慢性肉芽肿病和杜氏肌营养不良症等。
不过，科学研究执法人员没有对较长时间有机体巨噬细胞的X等位突变同步进行测序，而是用于了一种有两个相同的X等位突变的特别巨噬细胞特性。与均具有X等位突变单原件的男性巨噬细胞相比较，这种巨噬细胞可透过更多的DNA同步进行测序。它还可以避免比对相比较女性巨噬细胞的两个X等位突变时碰到的核酸差异缺陷。
图像再现了DNA核酸的拼图破碎。图片来源：Ernesto del Aguila III（NHGRI）
依靠新的测序应用和比对方法，科学研究执法人员对有机体X等位突变同步进行了比对，随后用新开发的计算机程序组装降解了核酸的许多视频，并想尽办法缩小X等位突变上最大的这样一来核酸缺口，这是在等位突变之中间其余部分（着丝粒）发现的大概300万个单调DNADNA。
由于没有可供检验组装这种整体单调的DNA核酸可用性的方法，科学研究执法人员执行了几个验证步骤以借助确定所降解核酸的有效性。
该报告的编者Karen Miga博士感叹：“我们真的突变组之中这些过去未知的位点在个体之中间是极为相同的，但是最重要的是开始注意到这些差异如何导致有机体生物学和病因。”
据称，这项科学研究是Telomere-to-Telomere (T2T) consortium计划案的一其余部分，该计划案由NHGRI其余部分支助，用以产生有机体突变组的零碎参考核酸。目前为止，T2T准备继续借助妥善处理这样一来的有机体等位突变，以期在2020年产生零碎的有机体突变组核酸。
值得注意来历：
Karen H. Miga, Sergey Koren, Adam M. Phillippy, et.al. Telomere-to-telomere assembly of a complete human X chromosome. Nature 14 July 2020
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